Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPEL1Q2QD12 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPEL1Q2QD12 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPEL1Q2QD12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPEL1Q2QD12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPEL1Q2QD12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
RPEL1Q2QD12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPEL1Q2QD12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPEL1Q2QD12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPEL1Q2QD12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPEL1Q2QD12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPEL1Q2QD12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPEL1Q2QD12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPEL1Q2QD12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPEL1Q2QD12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms