Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF1Q15637 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF1Q15637 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF1Q15637 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF1Q15637 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SF1Q15637 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF1Q15637 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF1Q15637 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF1Q15637 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF1Q15637 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF1Q15637 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF1Q15637 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF1Q15637 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SF1Q15637 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF1Q15637 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF1Q15637 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF1Q15637 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF1Q15637 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF1Q15637 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF1Q15637 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SF1Q15637 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF1Q15637 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF1Q15637 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF1Q15637 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF1Q15637 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF1Q15637 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SF1Q15637 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF1Q15637 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF1Q15637 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF1Q15637 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF1Q15637 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SF1Q15637 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF1Q15637 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF1Q15637 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SF1Q15637 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SF1Q15637 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF1Q15637 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF1Q15637 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SF1Q15637 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF1Q15637 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF1Q15637 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SF1Q15637 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF1Q15637 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF1Q15637 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF1Q15637 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF1Q15637 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SF1Q15637 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SF1Q15637 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SF1Q15637 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SF1Q15637 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SF1Q15637 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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