Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NWD1Q149M9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NWD1Q149M9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NWD1Q149M9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NWD1Q149M9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NWD1Q149M9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NWD1Q149M9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
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