Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSHL1Q14406 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSHL1Q14406 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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