Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIRBPQ14011 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIRBPQ14011 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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