Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1CQ13936 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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