Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNX3Q13761 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX3Q13761 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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