Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FHL3Q13643 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FHL3Q13643 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms