Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBRQ0VD83 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBRQ0VD83 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms