Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SLFN5Q08AF3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLFN5Q08AF3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SLFN5Q08AF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLFN5Q08AF3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLFN5Q08AF3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms