Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTDSPL2Q05D32 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTDSPL2Q05D32 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms