Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARDQ03181 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARDQ03181 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARDQ03181 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARDQ03181 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms