Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUCB2P80303 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NUCB2P80303 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUCB2P80303 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms