Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF3P78545 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF3P78545 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF3P78545 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF3P78545 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF3P78545 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF3P78545 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF3P78545 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF3P78545 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF3P78545 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELF3P78545 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ELF3P78545 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELF3P78545 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELF3P78545 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF3P78545 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF3P78545 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF3P78545 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF3P78545 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF3P78545 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF3P78545 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF3P78545 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF3P78545 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF3P78545 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF3P78545 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF3P78545 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF3P78545 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF3P78545 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF3P78545 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF3P78545 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF3P78545 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF3P78545 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF3P78545 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF3P78545 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF3P78545 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF3P78545 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF3P78545 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF3P78545 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF3P78545 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF3P78545 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF3P78545 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF3P78545 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF3P78545 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF3P78545 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ELF3P78545 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF3P78545 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF3P78545 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF3P78545 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF3P78545 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF3P78545 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF3P78545 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF3P78545 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF3P78545 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF3P78545 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF3P78545 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF3P78545 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF3P78545 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF3P78545 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF3P78545 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF3P78545 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF3P78545 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF3P78545 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF3P78545 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF3P78545 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF3P78545 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF3P78545 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF3P78545 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF3P78545 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF3P78545 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF3P78545 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF3P78545 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF3P78545 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF3P78545 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF3P78545 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF3P78545 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF3P78545 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF3P78545 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF3P78545 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF3P78545 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF3P78545 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF3P78545 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF3P78545 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms