Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TPM4P67936 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPM4P67936 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPM4P67936 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPM4P67936 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPM4P67936 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPM4P67936 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM4P67936 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM4P67936 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM4P67936 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM4P67936 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPM4P67936 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM4P67936 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM4P67936 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPM4P67936 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM4P67936 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM4P67936 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM4P67936 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM4P67936 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM4P67936 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPM4P67936 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM4P67936 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM4P67936 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM4P67936 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM4P67936 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM4P67936 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPM4P67936 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM4P67936 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM4P67936 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM4P67936 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM4P67936 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM4P67936 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPM4P67936 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM4P67936 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM4P67936 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM4P67936 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM4P67936 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM4P67936 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPM4P67936 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPM4P67936 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPM4P67936 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPM4P67936 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPM4P67936 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TPM4P67936 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM4P67936 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM4P67936 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM4P67936 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM4P67936 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM4P67936 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPM4P67936 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPM4P67936 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM4P67936 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM4P67936 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM4P67936 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM4P67936 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM4P67936 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPM4P67936 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TPM4P67936 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms