Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK11-1P61568 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms