Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00205P59089 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms