Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTTPP55157 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTTPP55157 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTTPP55157 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTTPP55157 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTTPP55157 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTTPP55157 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTTPP55157 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTTPP55157 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTTPP55157 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTTPP55157 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTTPP55157 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTTPP55157 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTTPP55157 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTTPP55157 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTTPP55157 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTTPP55157 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTTPP55157 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTTPP55157 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTTPP55157 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTTPP55157 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTTPP55157 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTTPP55157 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTTPP55157 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTTPP55157 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTTPP55157 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTTPP55157 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTTPP55157 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTTPP55157 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTTPP55157 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTTPP55157 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTTPP55157 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTTPP55157 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTTPP55157 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTTPP55157 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTTPP55157 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTTPP55157 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTTPP55157 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTTPP55157 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTTPP55157 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTTPP55157 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTTPP55157 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTTPP55157 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTTPP55157 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTTPP55157 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTTPP55157 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTTPP55157 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTTPP55157 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTTPP55157 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTTPP55157 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTTPP55157 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTTPP55157 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTTPP55157 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTTPP55157 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTTPP55157 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTTPP55157 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTTPP55157 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MTTPP55157 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTTPP55157 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTTPP55157 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTTPP55157 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTTPP55157 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTTPP55157 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTTPP55157 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTTPP55157 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTTPP55157 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTTPP55157 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTTPP55157 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTTPP55157 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTTPP55157 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms