Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFAP3P55082 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFAP3P55082 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MFAP3P55082 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFAP3P55082 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms