Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNB3P54284 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNB3P54284 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CACNB3P54284 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNB3P54284 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms