Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BRCA2P51587 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRCA2P51587 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BRCA2P51587 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms