Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2AP49459 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2AP49459 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2AP49459 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2AP49459 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2AP49459 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2AP49459 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2AP49459 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2AP49459 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2AP49459 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2AP49459 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2AP49459 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2AP49459 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2AP49459 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2AP49459 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2AP49459 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2AP49459 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2AP49459 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2AP49459 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2AP49459 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2AP49459 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2AP49459 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2AP49459 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2AP49459 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms