Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD8P48556 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms