Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC10P48553 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10P48553 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms