Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A3P47895 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH1A3P47895 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A3P47895 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms