Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL28P46779 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL28P46779 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL28P46779 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL28P46779 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL28P46779 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL28P46779 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL28P46779 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL28P46779 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL28P46779 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL28P46779 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL28P46779 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL28P46779 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL28P46779 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL28P46779 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL28P46779 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL28P46779 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL28P46779 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL28P46779 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL28P46779 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms