Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRKP46108 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRKP46108 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRKP46108 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRKP46108 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRKP46108 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRKP46108 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRKP46108 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRKP46108 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRKP46108 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CRKP46108 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CRKP46108 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CRKP46108 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CRKP46108 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRKP46108 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRKP46108 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRKP46108 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRKP46108 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRKP46108 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRKP46108 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRKP46108 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRKP46108 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRKP46108 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRKP46108 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRKP46108 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRKP46108 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRKP46108 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRKP46108 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRKP46108 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRKP46108 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRKP46108 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRKP46108 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRKP46108 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRKP46108 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRKP46108 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRKP46108 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRKP46108 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRKP46108 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRKP46108 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRKP46108 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CRKP46108 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRKP46108 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRKP46108 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRKP46108 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRKP46108 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRKP46108 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRKP46108 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRKP46108 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRKP46108 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRKP46108 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRKP46108 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CRKP46108 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRKP46108 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRKP46108 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRKP46108 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRKP46108 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRKP46108 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRKP46108 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRKP46108 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRKP46108 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRKP46108 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRKP46108 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRKP46108 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRKP46108 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CRKP46108 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CRKP46108 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CRKP46108 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRKP46108 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CRKP46108 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRKP46108 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRKP46108 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRKP46108 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRKP46108 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRKP46108 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRKP46108 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRKP46108 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRKP46108 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CRKP46108 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRKP46108 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRKP46108 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRKP46108 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRKP46108 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRKP46108 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRKP46108 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRKP46108 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRKP46108 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRKP46108 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRKP46108 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRKP46108 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRKP46108 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRKP46108 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms