Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOLR3P41439 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR3P41439 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms