Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGP37231 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGP37231 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGP37231 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGP37231 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGP37231 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGP37231 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGP37231 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGP37231 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGP37231 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGP37231 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGP37231 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGP37231 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGP37231 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGP37231 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGP37231 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARGP37231 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARGP37231 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARGP37231 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARGP37231 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGP37231 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGP37231 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGP37231 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGP37231 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGP37231 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGP37231 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGP37231 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGP37231 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGP37231 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGP37231 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGP37231 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGP37231 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGP37231 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGP37231 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGP37231 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGP37231 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGP37231 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGP37231 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGP37231 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGP37231 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGP37231 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGP37231 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGP37231 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGP37231 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGP37231 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGP37231 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGP37231 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGP37231 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGP37231 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGP37231 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGP37231 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGP37231 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGP37231 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGP37231 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGP37231 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGP37231 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGP37231 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGP37231 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGP37231 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGP37231 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGP37231 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGP37231 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGP37231 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGP37231 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGP37231 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGP37231 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGP37231 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGP37231 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGP37231 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGP37231 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGP37231 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGP37231 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGP37231 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGP37231 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGP37231 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGP37231 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGP37231 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGP37231 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGP37231 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms