Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC1P33527 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC1P33527 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC1P33527 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC1P33527 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms