Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR1P32246 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR1P32246 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR1P32246 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR1P32246 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR1P32246 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR1P32246 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR1P32246 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR1P32246 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR1P32246 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR1P32246 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR1P32246 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR1P32246 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR1P32246 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR1P32246 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR1P32246 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR1P32246 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR1P32246 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR1P32246 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCR1P32246 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCR1P32246 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCR1P32246 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR1P32246 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR1P32246 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR1P32246 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR1P32246 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR1P32246 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR1P32246 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR1P32246 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR1P32246 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR1P32246 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR1P32246 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR1P32246 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR1P32246 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR1P32246 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR1P32246 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR1P32246 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR1P32246 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR1P32246 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR1P32246 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR1P32246 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR1P32246 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR1P32246 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR1P32246 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR1P32246 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR1P32246 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR1P32246 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR1P32246 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR1P32246 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR1P32246 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR1P32246 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR1P32246 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR1P32246 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR1P32246 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR1P32246 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR1P32246 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR1P32246 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR1P32246 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR1P32246 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR1P32246 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCR1P32246 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCR1P32246 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR1P32246 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR1P32246 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR1P32246 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR1P32246 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR1P32246 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR1P32246 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR1P32246 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR1P32246 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR1P32246 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR1P32246 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR1P32246 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR1P32246 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR1P32246 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR1P32246 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR1P32246 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR1P32246 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR1P32246 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR1P32246 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR1P32246 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms