Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTGFP29279 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTGFP29279 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTGFP29279 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTGFP29279 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTGFP29279 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTGFP29279 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTGFP29279 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTGFP29279 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTGFP29279 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTGFP29279 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTGFP29279 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTGFP29279 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTGFP29279 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTGFP29279 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTGFP29279 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTGFP29279 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTGFP29279 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTGFP29279 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTGFP29279 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CTGFP29279 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTGFP29279 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTGFP29279 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTGFP29279 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTGFP29279 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTGFP29279 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTGFP29279 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTGFP29279 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CTGFP29279 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTGFP29279 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTGFP29279 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTGFP29279 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTGFP29279 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTGFP29279 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTGFP29279 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTGFP29279 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTGFP29279 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTGFP29279 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTGFP29279 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTGFP29279 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTGFP29279 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTGFP29279 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTGFP29279 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTGFP29279 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTGFP29279 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTGFP29279 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTGFP29279 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CTGFP29279 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTGFP29279 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTGFP29279 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTGFP29279 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTGFP29279 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTGFP29279 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CTGFP29279 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CTGFP29279 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTGFP29279 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTGFP29279 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTGFP29279 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTGFP29279 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTGFP29279 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTGFP29279 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTGFP29279 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTGFP29279 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTGFP29279 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTGFP29279 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTGFP29279 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTGFP29279 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTGFP29279 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTGFP29279 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTGFP29279 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTGFP29279 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTGFP29279 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTGFP29279 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTGFP29279 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTGFP29279 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTGFP29279 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTGFP29279 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTGFP29279 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTGFP29279 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTGFP29279 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTGFP29279 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTGFP29279 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTGFP29279 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTGFP29279 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTGFP29279 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTGFP29279 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTGFP29279 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTGFP29279 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTGFP29279 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTGFP29279 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTGFP29279 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTGFP29279 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTGFP29279 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTGFP29279 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTGFP29279 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTGFP29279 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTGFP29279 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTGFP29279 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTGFP29279 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CTGFP29279 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms