Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SSFA2P28290 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SSFA2P28290 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SSFA2P28290 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms