Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARK3P27448 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARK3P27448 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MARK3P27448 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARK3P27448 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARK3P27448 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARK3P27448 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARK3P27448 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARK3P27448 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARK3P27448 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARK3P27448 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARK3P27448 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARK3P27448 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARK3P27448 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MARK3P27448 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARK3P27448 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MARK3P27448 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MARK3P27448 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARK3P27448 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARK3P27448 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARK3P27448 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARK3P27448 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARK3P27448 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARK3P27448 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARK3P27448 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARK3P27448 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARK3P27448 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARK3P27448 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARK3P27448 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARK3P27448 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARK3P27448 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARK3P27448 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARK3P27448 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARK3P27448 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARK3P27448 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MARK3P27448 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARK3P27448 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARK3P27448 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARK3P27448 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARK3P27448 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARK3P27448 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARK3P27448 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARK3P27448 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARK3P27448 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARK3P27448 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARK3P27448 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARK3P27448 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MARK3P27448 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARK3P27448 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARK3P27448 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARK3P27448 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARK3P27448 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARK3P27448 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARK3P27448 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARK3P27448 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARK3P27448 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARK3P27448 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARK3P27448 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARK3P27448 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARK3P27448 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARK3P27448 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARK3P27448 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARK3P27448 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARK3P27448 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MARK3P27448 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARK3P27448 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARK3P27448 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARK3P27448 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARK3P27448 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARK3P27448 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARK3P27448 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms