Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL13P26373 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL13P26373 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL13P26373 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL13P26373 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL13P26373 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL13P26373 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL13P26373 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPL13P26373 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPL13P26373 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPL13P26373 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPL13P26373 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPL13P26373 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL13P26373 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL13P26373 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL13P26373 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL13P26373 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL13P26373 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL13P26373 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL13P26373 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL13P26373 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL13P26373 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL13P26373 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL13P26373 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL13P26373 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL13P26373 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL13P26373 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL13P26373 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL13P26373 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL13P26373 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL13P26373 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL13P26373 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL13P26373 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL13P26373 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL13P26373 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL13P26373 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL13P26373 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL13P26373 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL13P26373 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL13P26373 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL13P26373 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL13P26373 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL13P26373 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL13P26373 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL13P26373 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL13P26373 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL13P26373 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL13P26373 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL13P26373 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPL13P26373 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPL13P26373 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RPL13P26373 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL13P26373 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL13P26373 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL13P26373 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL13P26373 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL13P26373 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL13P26373 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL13P26373 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL13P26373 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL13P26373 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL13P26373 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL13P26373 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL13P26373 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL13P26373 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL13P26373 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL13P26373 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL13P26373 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL13P26373 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL13P26373 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL13P26373 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL13P26373 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL13P26373 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL13P26373 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL13P26373 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL13P26373 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL13P26373 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL13P26373 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL13P26373 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL13P26373 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL13P26373 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL13P26373 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL13P26373 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL13P26373 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms