Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO2P25791 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO2P25791 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO2P25791 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMO2P25791 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO2P25791 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO2P25791 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO2P25791 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMO2P25791 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMO2P25791 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMO2P25791 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMO2P25791 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMO2P25791 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMO2P25791 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO2P25791 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO2P25791 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO2P25791 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO2P25791 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO2P25791 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMO2P25791 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMO2P25791 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMO2P25791 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMO2P25791 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMO2P25791 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMO2P25791 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMO2P25791 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMO2P25791 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO2P25791 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO2P25791 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO2P25791 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO2P25791 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO2P25791 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO2P25791 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO2P25791 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO2P25791 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO2P25791 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO2P25791 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO2P25791 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO2P25791 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO2P25791 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO2P25791 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO2P25791 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO2P25791 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO2P25791 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO2P25791 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO2P25791 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO2P25791 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO2P25791 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO2P25791 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO2P25791 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO2P25791 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO2P25791 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO2P25791 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO2P25791 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO2P25791 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO2P25791 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO2P25791 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO2P25791 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO2P25791 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO2P25791 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO2P25791 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO2P25791 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO2P25791 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO2P25791 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO2P25791 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO2P25791 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO2P25791 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO2P25791 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms