Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPAP23025 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPAP23025 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPAP23025 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPAP23025 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPAP23025 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPAP23025 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPAP23025 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPAP23025 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPAP23025 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPAP23025 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPAP23025 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPAP23025 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPAP23025 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPAP23025 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPAP23025 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPAP23025 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPAP23025 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPAP23025 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPAP23025 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPAP23025 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPAP23025 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPAP23025 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPAP23025 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XPAP23025 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPAP23025 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPAP23025 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPAP23025 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPAP23025 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPAP23025 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPAP23025 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPAP23025 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPAP23025 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPAP23025 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPAP23025 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPAP23025 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPAP23025 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XPAP23025 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPAP23025 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPAP23025 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPAP23025 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPAP23025 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPAP23025 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPAP23025 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPAP23025 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPAP23025 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPAP23025 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPAP23025 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPAP23025 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPAP23025 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPAP23025 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPAP23025 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPAP23025 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPAP23025 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPAP23025 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XPAP23025 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPAP23025 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPAP23025 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPAP23025 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPAP23025 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPAP23025 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPAP23025 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPAP23025 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPAP23025 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPAP23025 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPAP23025 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPAP23025 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPAP23025 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPAP23025 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPAP23025 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPAP23025 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPAP23025 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XPAP23025 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPAP23025 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPAP23025 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPAP23025 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPAP23025 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPAP23025 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPAP23025 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPAP23025 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPAP23025 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPAP23025 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms