Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB4P21439 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB4P21439 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB4P21439 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB4P21439 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB4P21439 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms