Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNA2P20248 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA2P20248 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms