Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL3P19876 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms