Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RXRAP19793 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RXRAP19793 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RXRAP19793 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RXRAP19793 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RXRAP19793 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RXRAP19793 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RXRAP19793 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RXRAP19793 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RXRAP19793 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RXRAP19793 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RXRAP19793 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXRAP19793 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXRAP19793 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXRAP19793 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXRAP19793 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RXRAP19793 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RXRAP19793 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RXRAP19793 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RXRAP19793 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RXRAP19793 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RXRAP19793 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RXRAP19793 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RXRAP19793 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RXRAP19793 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RXRAP19793 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RXRAP19793 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RXRAP19793 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RXRAP19793 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RXRAP19793 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RXRAP19793 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RXRAP19793 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RXRAP19793 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RXRAP19793 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRAP19793 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRAP19793 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRAP19793 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRAP19793 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRAP19793 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRAP19793 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRAP19793 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRAP19793 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRAP19793 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRAP19793 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRAP19793 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRAP19793 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRAP19793 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRAP19793 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRAP19793 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRAP19793 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RXRAP19793 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RXRAP19793 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RXRAP19793 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RXRAP19793 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RXRAP19793 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RXRAP19793 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RXRAP19793 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RXRAP19793 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RXRAP19793 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RXRAP19793 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RXRAP19793 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RXRAP19793 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RXRAP19793 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RXRAP19793 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RXRAP19793 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RXRAP19793 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RXRAP19793 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RXRAP19793 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RXRAP19793 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RXRAP19793 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RXRAP19793 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RXRAP19793 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RXRAP19793 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RXRAP19793 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RXRAP19793 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXRAP19793 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXRAP19793 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXRAP19793 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXRAP19793 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXRAP19793 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXRAP19793 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXRAP19793 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RXRAP19793 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RXRAP19793 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RXRAP19793 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RXRAP19793 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RXRAP19793 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RXRAP19793 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RXRAP19793 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RXRAP19793 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXRAP19793 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXRAP19793 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms