Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN1P18031 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN1P18031 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms