Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF28P17035 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF28P17035 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF28P17035 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms