Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGB4P16144 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGB4P16144 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms