Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM228BP0C875 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms