Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFTA3P0C7M3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms