Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC3A2P08195 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC3A2P08195 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC3A2P08195 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms