Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNC2P02585 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC2P02585 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms