Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTAP01040 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTAP01040 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTAP01040 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTAP01040 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTAP01040 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTAP01040 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTAP01040 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTAP01040 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTAP01040 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTAP01040 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTAP01040 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTAP01040 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTAP01040 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTAP01040 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTAP01040 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTAP01040 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTAP01040 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTAP01040 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTAP01040 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTAP01040 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTAP01040 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTAP01040 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTAP01040 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTAP01040 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTAP01040 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTAP01040 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTAP01040 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTAP01040 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTAP01040 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTAP01040 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTAP01040 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTAP01040 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTAP01040 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTAP01040 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTAP01040 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSTAP01040 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTAP01040 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTAP01040 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTAP01040 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTAP01040 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTAP01040 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTAP01040 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTAP01040 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTAP01040 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTAP01040 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTAP01040 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTAP01040 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTAP01040 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTAP01040 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTAP01040 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTAP01040 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTAP01040 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTAP01040 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTAP01040 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTAP01040 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTAP01040 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTAP01040 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTAP01040 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.5 ms