Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSA2O95478 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSA2O95478 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSA2O95478 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSA2O95478 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSA2O95478 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSA2O95478 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSA2O95478 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSA2O95478 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSA2O95478 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSA2O95478 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSA2O95478 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSA2O95478 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSA2O95478 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSA2O95478 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSA2O95478 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSA2O95478 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSA2O95478 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSA2O95478 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSA2O95478 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSA2O95478 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSA2O95478 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSA2O95478 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSA2O95478 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSA2O95478 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSA2O95478 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSA2O95478 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSA2O95478 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSA2O95478 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSA2O95478 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSA2O95478 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSA2O95478 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSA2O95478 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSA2O95478 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSA2O95478 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSA2O95478 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSA2O95478 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSA2O95478 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSA2O95478 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSA2O95478 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSA2O95478 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSA2O95478 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSA2O95478 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSA2O95478 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSA2O95478 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSA2O95478 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSA2O95478 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSA2O95478 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSA2O95478 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSA2O95478 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSA2O95478 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSA2O95478 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSA2O95478 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSA2O95478 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSA2O95478 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSA2O95478 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSA2O95478 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSA2O95478 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSA2O95478 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSA2O95478 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSA2O95478 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSA2O95478 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSA2O95478 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSA2O95478 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSA2O95478 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSA2O95478 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSA2O95478 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSA2O95478 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSA2O95478 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSA2O95478 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSA2O95478 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSA2O95478 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSA2O95478 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSA2O95478 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSA2O95478 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSA2O95478 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSA2O95478 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSA2O95478 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms